Diversidade genética de Hemileia vastatrix utilizando marcador molecular AFLP

Abstract

Esse estudo teve como objetivo analisar a diversidade genética de 14 isolados de Hemileia vastatrix utilizando o marcador AFLP. Dentre eles, dois isolados do CIFC, Oeiras, Portugal biologicamente caracterizados como raça II, três do Brasil, caracterizados em 1986, como raça I, II e III, e nove provenientes de lavouras cafeeiras de Minas Gerais e Espírito Santo coletadas em 2006. As amplificações seletivas dos DNAs foram feitas utilizando quatro combinações de oligonucleotídeos iniciadores contendo três bases adicionais na extremidade 3’. As 93 bandas polimórficas analisadas geraram um dendrograma que dividiu os isolados em seis grupos. No grupo I foram agrupados os isolados de Portugal, Brasil (caracterizados como raças em 1986) e um isolado do Triângulo Mineiro, e no grupo II, os isolados da Zona da Mata, Alto Paranaíba e Sul de Minas Gerais. Os demais isolados formaram os grupos individuais III (região central de MG), IV (Zona da Mata, MG), V (Região Serrana, Espírito Santo) e VI (Zona da Mata, MG). A diversidade genética total (Ht) dos isolados agrupados dentro das nove populações definidas pelas origens foi de 0,313 e a diferenciação genética entre populações (Gst) de 0,916. Baseado no agrupamento UPGMA os isolados foram agrupados em seis populações onde a diversidade genética total (Ht) foi de 0,285 e a diferenciação genética entre populações (Gst) de 0,886. Esses resultados indicam que a variabilidade genética de H. vastatrix entre os isolados é bastante elevada e que os isolados provenientes Do campo possuem baixa similaridade genética com as raças caracterizadas em 1986 e a raça II de Portugal. Um estudo mais amplo e detalhado envolvendo outros isolados, mais representativos da população atual no campo será necessário para definir os isolados prevalecentes em cada região.

The objective of this study was to analyze genotypic diversity of 14 Hemileia vastatrix isolates by using AFLP markers. Among them, two isolates from CIFC, Oeiras, Portugal, biologically characterized as race II, three from Brazil, characterized in 1986 as race I, II and III, and nine field isolates, colleted in 2006 in the Minas Gerais and Espírito Santo States coffee plantations. The selective amplifications of DNA were made using four primers combinations containing three selective nucleotides at the 3'-end. The analysis of 93 polymorphic bands generated a dendrogram which separated the isolates into six clusters. The cluster I was formed by the CIFC’s race II, the Brazilian races, characterized in 1986, and one isolate from Triângulo Mineiro. The cluster II included the isolates from Zona da Mata, Alto Paranaíba and south of Minas Gerais State. The others isolates were separated among the individual clusters III (isolate from central area of MG), IV (isolate of Zona da Mata, MG), V (Serrana area of Espírito Santo Satate) and VI (Zona da Mata, MG). The total gene diversity (Ht) of the clustered isolates inside of the nine populations defined by the geographic origins was 0.313 and the genetic differentiation among populations (Gst) was 0.916. Based on the UPGMA method the isolates were clustered into six populations where the total genetic diversity (Ht) was 0.285 and the genetic differentiation among populations (Gst) was 0.886. Those results indicated that the genetic variability among H. vastatrix isolates is quite high and that the field isolates possess low genetic similarity with the races characterized in 1986 and the race II of Portugal. More extensive and detailed study of representative isolates in the current population of H. vastatrix in the Brazilian coffee fields are necessary to find out the prevalent ones.