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Localização de marcador molecular derivado de EST potencialmente associado ao domínio LRR em mapa genético de Coffea arabica

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dc.contributor.author Alvarenga, Samuel Mazzinghy pt_BR
dc.contributor.author Caixeta, Eveline Teixeira pt_BR
dc.contributor.author Andrade, Flavia Thiebaut pt_BR
dc.contributor.author Maciel, Bárbara Hufnagel pt_BR
dc.contributor.author Zambolim, Eunize Maciel pt_BR
dc.contributor.author Xavier, Katia Viana pt_BR
dc.contributor.author Sakiyama, Ney Sussumu pt_BR
dc.contributor.other Embrapa - Café pt_BR
dc.date 2007-11-26 11:43:30.73 pt_BR
dc.date.accessioned 2015-01-14T13:47:19Z
dc.date.available 2015-01-14T13:47:19Z
dc.date.issued 2007 pt_BR
dc.identifier.citation Alvarenga, Samuel Mazzinghy; Caixeta, Eveline Teixeira; Andrade, Flávia Thiebaut; Maciel, Bárbara Hufnagel; Zambolim, Eunize Maciel; Xavier, Kátia Viana; Sakiyama, Ney Sussumu. Localização de marcador molecular derivado de EST potencialmente associado ao domínio LRR em mapa genético de Coffea arabica. In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : Águas de Lindóia, SP : 2007). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa - Café, 2007. (1 CD-ROM), 5p. pt_BR
dc.identifier.other 179995_Art073 pt_BR
dc.identifier.uri http://www.sbicafe.ufv.br/handle/123456789/2297
dc.description Trabalho apresentado no Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : 2007 : Águas de Lindóia, SP). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007. pt_BR
dc.description.abstract O Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) gerou um banco de dados de 200.000 ESTs (Expressed Sequence Tags). O banco de dados foi minerado por meio de análise in silico e 12009 seqüências potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças foram identificadas. A partir dessas seqüências foram desenhados 40 oligonucleotídeos, iniciadores específicos para amplificar seqüências do DNA genômico do cafeeiro. As condições de reação e amplificação dos iniciadores sintetizados foram ajustadas. Vinte e nove iniciadores amplificaram fragmentos de aproximadamente 400 pb, exibindo bandas únicas e bem definidas, e apenas um deles foi polimórfico entre os indivíduos resistentes e susceptíveis. O iniciador CARF 005 amplificou um fragmento nos 154 indivíduos F2 da população H464-2. Essa análise permitiu verificar o posicionamento desse marcador no grupo de ligação 9, a 36,2 cM do marcador K13c no mapa genético de Coffea arabica previamente desenvolvido com marcadores RAPD. pt_BR
dc.description.abstract Twelve thousand and nine sequences potentially involved in the resistance of the coffee tree to diseases were identified in the Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) database by in silico analysis. Based on those sequences, specific primers were designed in order to amplify sequences of the coffee genomic DNA. Forty specific primers were obtained and their reaction and amplification conditions were tested. Twenty nine primers amplified fragments of approximately 400 bp, showing unique and sharp bands, and only one was polymorphic between the resistant and susceptible genotypes. The primer CARF 005 amplified one fragment in 154 F2 individuals of the population H464-2. That analysis permitted to verify the position of this marker in the linkage group 9, at 36,2 cM from marker K13c in the genetic map of Coffea arabica previously developed with RAPD markers. en
dc.description.sponsorship Embrapa - Café pt_BR
dc.language.iso pt_BR pt_BR
dc.subject Genoma Café Coffea Oligonucleotídeos Iniciadores específicos pt_BR
dc.subject Coffee Genome Coffea Specific primers en
dc.subject.classification Genética, Melhoramento e Biotecnologia do Cafeeiro pt_BR
dc.title Localização de marcador molecular derivado de EST potencialmente associado ao domínio LRR em mapa genético de Coffea arabica pt_BR
dc.title [Localization of molecular marker from EST potentially associated with the LRR domain in genetic map of Coffea arabica] en
dc.title.alternative [Localization of molecular marker from EST potentially associated with the LRR domain in genetic map of Coffea arabica] en
dc.type Artigo pt_BR

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